Yeni tasarlanan ve daha önceden çalışılmış bazı anti-HIV integraz ligandlarının autodock vina ile HIV-1 integraz enzimi katalitik öz bölgesine yerleştirilmesi ve analizleri
Citation
Ercan, S. (2016). Yeni tasarlanan ve daha çnceden çalışılmış bazı anti-HIV integraz ligandlarının autodock vina ile HIV-1 integraz enzimi katalitik öz bölgesine yerleştirilmesi ve analizleri. Batman Üniversitesi Yaşam Bilimleri Dergisi, 6 (1), ss. 247-269.Abstract
Kazanılmış İmmün Yetmezlik Sendromu (AIDS) modern dünyanın en önemli hastalıklarından biridir. Bu
hastalığa insan immün yetmezlik virüsü (HIV) neden olmaktadır. HIV-1 integraz enzimi diğer çalışılan
enzimler proteaz ve ters transkriptaza göre daha geç ilgi görmüştür. Geliştirilen ilaçlara sürekli direnç
oluşması yeni ilaç adaylarının bulunmasını zorunlu kılmaktadır. Bu çalışmada HIV-1 integraz enziminin
katalitik öz bölgesinin bir modeli hazırlanarak moleküler dinamik simülasyonuyla davranışları incelendi. Bu
model hedef alınarak, yeni geliştirilen 6 ligandın yanı sıra, bilinen ancak HIV-1 integraz inhibitör adayı olarak
ilk defa kullanılan 4 ligand ve daha önce teorik ve/veya uygulamalı olarak çalışılan 32 ligand yerleştirildi.
Yerleştirilen ligandların proteinle etkileşimleri incelendi. Yeni geliştirilen ligandlardan LGA, LGD ve
LGE’nin ortalamanın üzerinde bir yerleştirme skoruna sahip olduğu görüldü Acquired Immuno Deficiency Syndrome (AIDS) is the one of most important pandemic of modern world.
Human Immunodeficiency Virus (HIV) is the causative agent of this disease. HIV-1 integrase have attracted
lately than the other studied enzymes protease and reverse transcriptase. It is a needful to develop new drug
candidates due to continuously growth of drug resistance. A catalytic core domain model of HIV-1 integrase
was created and the behaviors of protein was examined by molecular dynamics simulation. By targeting this
model, besides 6 newly designed ligands, 4 known but used for the first time ligands and 32 previously
theoretical and/or in vitro studied ligands were docked. Interactions of docked ligands with protein were
inspected. Among the designed ligands it is seen LGA, LGD and LGE have docking scores of above average.
Source
Batman Üniversitesi Yaşam Bilimleri DergisiVolume
6Issue
1URI
http://www.yasambilimleridergisi.com/makale/pdf/1453467784.pdfhttps://hdl.handle.net/20.500.12402/1569