Taming the late Quaternary phylogeography of the Eurasiatic wild ass through ancient and modern DNA

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0002-6369-0913en_US
dc.contributor.authorGündem, Can Yumni
dc.contributor.authorBennett, E Andrew
dc.contributor.authorChamplot, Sophie
dc.contributor.authorPeters, Joris
dc.contributor.authorArbuckle, Benjamin S
dc.contributor.authorGuimaraes, Silvia
dc.contributor.authorPruvos, Mlanie
dc.contributor.authorDavid, Shirli Bar
dc.contributor.authorDavis, Simon J M
dc.contributor.authorGautier, Mathieu
dc.contributor.authorKaczensky, Petra
dc.contributor.authorKuehn, Ralph
dc.contributor.authorMashkour, Marjan
dc.contributor.authorMorales, Arturo
dc.contributor.authorMuiz, Morales
dc.contributor.authorPucher, Erich
dc.contributor.authorTournepiche, Jean François
dc.contributor.authorUerpmann, HansPeter
dc.contributor.authorBlşescu, Adrian
dc.contributor.authorGermonpr, Mietje
dc.contributor.authorMoull, Pierre Elie
dc.contributor.authorÖtzan, Aliye
dc.contributor.authorWalzer, Chris
dc.contributor.authorGrange, Thierry
dc.contributor.authorGeigl, Eva Maria
dc.date.accessioned2021-03-16T11:06:19Z
dc.date.available2021-03-16T11:06:19Z
dc.date.issued2017-04-19en_US
dc.departmentBatman Üniversitesi Fen - Edebiyat Fakültesi Arkeoloji Bölümüen_US
dc.description.abstractTaxonomic over-splitting of extinct or endangered taxa, due to an incomplete knowledge of both skeletal morphological variability and the geographical ranges of past populations, continues to confuse the link between isolated extant populations and their ancestors. This is particularly problematic with the genus Equus. To more reliably determine the evolution and phylogeographic history of the endangered Asiatic wild ass, we studied the genetic diversity and inter-relationships of both extinct and extant populations over the last 100,000 years, including samples throughout its previous range from Western Europe to Southwest and East Asia. Using 229 bp of the mitochondrial hypervariable region, an approach which allowed the inclusion of information from extremely poorly preserved ancient samples, we classify all non-African wild asses into eleven clades that show a clear phylogeographic structure revealing their phylogenetic history. This study places the extinct European wild ass, E. hydruntinus, the phylogeny of which has been debated since the end of the 19th century, into its phylogenetic context within the Asiatic wild asses and reveals recent mitochondrial introgression between populations currently regarded as separate species. The phylogeographic organization of clades resulting from these efforts can be used not only to improve future taxonomic determination of a poorly characterized group of equids, but also to identify historic ranges, interbreeding events between various populations, and the impact of ancient climatic changes. In addition, appropriately placing extant relict populations into a broader phylogeographic and genetic context can better inform ongoing conservation strategies for this highly-endangered species.en_US
dc.description.abstractHem iskelet morfolojik değişkenliği hem de geçmiş popülasyonların coğrafi aralıkları hakkındaki eksik bilgi nedeniyle, nesli tükenmiş veya nesli tükenmekte olan taksonların taksonomik aşırı bölünmesi, izole edilmiş mevcut popülasyonlar ve onların ataları arasındaki bağlantıyı karıştırmaya devam ediyor. Bu özellikle Equus cinsi için sorunludur. Nesli tükenmekte olan Asya yaban eşeği evrimini ve filocoğrafik tarihini daha güvenilir bir şekilde belirlemek için, Batı Avrupa'dan Güneybatıya ve Doğu'ya kadar önceki aralıktaki örnekler de dahil olmak üzere, son 100.000 yılda hem soyu tükenmiş hem de mevcut popülasyonların genetik çeşitliliğini ve karşılıklı ilişkilerini inceledik. Asya. Aşırı derecede kötü korunmuş antik örneklerden gelen bilgilerin dahil edilmesine izin veren bir yaklaşım olan mitokondriyal hiperdeğişken bölgenin 229 bp'sini kullanarak, tüm Afrika dışı yabani eşekleri filogenetik geçmişlerini açığa çıkaran net bir filocoğrafik yapı gösteren on bir sınıfa ayırıyoruz. Bu çalışma, soyoluşu 19. yüzyılın sonundan beri tartışılan, soyu tükenmiş Avrupa yaban eşeği E. hydruntinus'u Asya yaban eşeği içindeki filogenetik bağlamına yerleştiriyor ve şu anda ayrı türler olarak kabul edilen popülasyonlar arasındaki son mitokondriyal introgresyonu ortaya koyuyor. Bu çabalardan kaynaklanan soyların filocoğrafik organizasyonu, yalnızca kötü bir şekilde karakterize edilmiş bir eşitler grubunun gelecekteki taksonomik tespitini geliştirmek için değil, aynı zamanda tarihi aralıkları, çeşitli popülasyonlar arasındaki melezleşen olayları ve eski iklim değişikliklerinin etkisini belirlemek için de kullanılabilir. Ek olarak, mevcut kalıntı popülasyonları daha geniş bir filocoğrafik ve genetik bağlama uygun şekilde yerleştirmek, nesli tükenmekte olan bu türler için devam eden koruma stratejilerini daha iyi bilgilendirebilir.en_US
dc.identifier.citationBennett EA, Champlot S, Peters J, Arbuckle BS, Guimaraes S, Pruvost M, et al. (2017). Taming the late Quaternary phylogeography of the Eurasiatic wild ass through ancient and modern DNA. PLoS One, vol. 12, no. 4en_US
dc.identifier.issn1932-6203
dc.identifier.issue4en_US
dc.identifier.scopusqualityQ1en_US
dc.identifier.urihttps://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0174216
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0174216
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12402/2700
dc.identifier.volume12en_US
dc.identifier.wosqualityQ1en_US
dc.indekslendigikaynakWeb of Scienceen_US
dc.language.isoenen_US
dc.publisherPLoS Oneen_US
dc.relation.isversionof10.1371/journal.pone.0174216en_US
dc.relation.journalPLoS Oneen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.rightsAttribution-NonCommercial-ShareAlike 3.0 United States*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/us/*
dc.subjectArkeozoolojien_US
dc.subjectEquus-Hydruntınusen_US
dc.subjectFilogenetik Analizen_US
dc.subjectEvrimsel Tarihen_US
dc.subjectMaksimum-Likitliken_US
dc.subjectYüksek Çözünürlüken_US
dc.subjectKontrol Bölgesien_US
dc.subjectAt Equusen_US
dc.titleTaming the late Quaternary phylogeography of the Eurasiatic wild ass through ancient and modern DNAen_US
dc.title.alternativeAvrasya yaban eşeği geç Kuvaterner filocoğrafyasını antik ve modern DNA yoluyla evcilleştirmeken_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
pone.0174216.pdf
Boyut:
3.84 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Fen - Edebiyat Fakültesi, Arkeoloji Bölümü, Makale Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu