Yeni tasarlanan ve daha önceden çalışılmış bazı anti-HIV integraz ligandlarının autodock vina ile HIV-1 integraz enzimi katalitik öz bölgesine yerleştirilmesi ve analizleri

dc.authoridTR31646en_US
dc.contributor.authorErcan, Selami
dc.date.accessioned2016-05-04T07:44:08Z
dc.date.available2016-05-04T07:44:08Z
dc.date.issued2016
dc.departmentBatman Üniversitesi Sağlık Yüksekokulu Hemşirelik Bölümüen_US
dc.description.abstractKazanılmış İmmün Yetmezlik Sendromu (AIDS) modern dünyanın en önemli hastalıklarından biridir. Bu hastalığa insan immün yetmezlik virüsü (HIV) neden olmaktadır. HIV-1 integraz enzimi diğer çalışılan enzimler proteaz ve ters transkriptaza göre daha geç ilgi görmüştür. Geliştirilen ilaçlara sürekli direnç oluşması yeni ilaç adaylarının bulunmasını zorunlu kılmaktadır. Bu çalışmada HIV-1 integraz enziminin katalitik öz bölgesinin bir modeli hazırlanarak moleküler dinamik simülasyonuyla davranışları incelendi. Bu model hedef alınarak, yeni geliştirilen 6 ligandın yanı sıra, bilinen ancak HIV-1 integraz inhibitör adayı olarak ilk defa kullanılan 4 ligand ve daha önce teorik ve/veya uygulamalı olarak çalışılan 32 ligand yerleştirildi. Yerleştirilen ligandların proteinle etkileşimleri incelendi. Yeni geliştirilen ligandlardan LGA, LGD ve LGE’nin ortalamanın üzerinde bir yerleştirme skoruna sahip olduğu görüldüen_US
dc.description.abstractAcquired Immuno Deficiency Syndrome (AIDS) is the one of most important pandemic of modern world. Human Immunodeficiency Virus (HIV) is the causative agent of this disease. HIV-1 integrase have attracted lately than the other studied enzymes protease and reverse transcriptase. It is a needful to develop new drug candidates due to continuously growth of drug resistance. A catalytic core domain model of HIV-1 integrase was created and the behaviors of protein was examined by molecular dynamics simulation. By targeting this model, besides 6 newly designed ligands, 4 known but used for the first time ligands and 32 previously theoretical and/or in vitro studied ligands were docked. Interactions of docked ligands with protein were inspected. Among the designed ligands it is seen LGA, LGD and LGE have docking scores of above average.en_US
dc.identifier.citationErcan, S. (2016). Yeni tasarlanan ve daha çnceden çalışılmış bazı anti-HIV integraz ligandlarının autodock vina ile HIV-1 integraz enzimi katalitik öz bölgesine yerleştirilmesi ve analizleri. Batman Üniversitesi Yaşam Bilimleri Dergisi, 6 (1), ss. 247-269.en_US
dc.identifier.endpage269en_US
dc.identifier.issn2147-4877
dc.identifier.issn2459-0614
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.other1453467784
dc.identifier.startpage247en_US
dc.identifier.urihttp://www.yasambilimleridergisi.com/makale/pdf/1453467784.pdf
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12402/1569
dc.identifier.volume6en_US
dc.language.isotren_US
dc.publisherBatman Üniversitesien_US
dc.relation.journalBatman Üniversitesi Yaşam Bilimleri Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Yayınıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectİntegrazen_US
dc.subjectAnti-HIV ilaç tasarımıen_US
dc.subjectLigand yerleştirmeen_US
dc.subjectMoleküler Dinamik Simülasyonuen_US
dc.subjectIntegrazeen_US
dc.subjectAnti-HIV drug designen_US
dc.subjectDockingen_US
dc.subjectMolecular Dynamics Simulationen_US
dc.titleYeni tasarlanan ve daha önceden çalışılmış bazı anti-HIV integraz ligandlarının autodock vina ile HIV-1 integraz enzimi katalitik öz bölgesine yerleştirilmesi ve analizlerien_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
1453467784.pdf
Boyut:
1.58 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.51 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama: