Yeni tasarlanan ve daha önceden çalışılmış bazı anti-HIV integraz ligandlarının autodock vina ile HIV-1 integraz enzimi katalitik öz bölgesine yerleştirilmesi ve analizleri
dc.authorid | TR31646 | en_US |
dc.contributor.author | Ercan, Selami | |
dc.date.accessioned | 2016-05-04T07:44:08Z | |
dc.date.available | 2016-05-04T07:44:08Z | |
dc.date.issued | 2016 | |
dc.department | Batman Üniversitesi Sağlık Yüksekokulu Hemşirelik Bölümü | en_US |
dc.description.abstract | Kazanılmış İmmün Yetmezlik Sendromu (AIDS) modern dünyanın en önemli hastalıklarından biridir. Bu hastalığa insan immün yetmezlik virüsü (HIV) neden olmaktadır. HIV-1 integraz enzimi diğer çalışılan enzimler proteaz ve ters transkriptaza göre daha geç ilgi görmüştür. Geliştirilen ilaçlara sürekli direnç oluşması yeni ilaç adaylarının bulunmasını zorunlu kılmaktadır. Bu çalışmada HIV-1 integraz enziminin katalitik öz bölgesinin bir modeli hazırlanarak moleküler dinamik simülasyonuyla davranışları incelendi. Bu model hedef alınarak, yeni geliştirilen 6 ligandın yanı sıra, bilinen ancak HIV-1 integraz inhibitör adayı olarak ilk defa kullanılan 4 ligand ve daha önce teorik ve/veya uygulamalı olarak çalışılan 32 ligand yerleştirildi. Yerleştirilen ligandların proteinle etkileşimleri incelendi. Yeni geliştirilen ligandlardan LGA, LGD ve LGE’nin ortalamanın üzerinde bir yerleştirme skoruna sahip olduğu görüldü | en_US |
dc.description.abstract | Acquired Immuno Deficiency Syndrome (AIDS) is the one of most important pandemic of modern world. Human Immunodeficiency Virus (HIV) is the causative agent of this disease. HIV-1 integrase have attracted lately than the other studied enzymes protease and reverse transcriptase. It is a needful to develop new drug candidates due to continuously growth of drug resistance. A catalytic core domain model of HIV-1 integrase was created and the behaviors of protein was examined by molecular dynamics simulation. By targeting this model, besides 6 newly designed ligands, 4 known but used for the first time ligands and 32 previously theoretical and/or in vitro studied ligands were docked. Interactions of docked ligands with protein were inspected. Among the designed ligands it is seen LGA, LGD and LGE have docking scores of above average. | en_US |
dc.identifier.citation | Ercan, S. (2016). Yeni tasarlanan ve daha çnceden çalışılmış bazı anti-HIV integraz ligandlarının autodock vina ile HIV-1 integraz enzimi katalitik öz bölgesine yerleştirilmesi ve analizleri. Batman Üniversitesi Yaşam Bilimleri Dergisi, 6 (1), ss. 247-269. | en_US |
dc.identifier.endpage | 269 | en_US |
dc.identifier.issn | 2147-4877 | |
dc.identifier.issn | 2459-0614 | |
dc.identifier.issue | 1 | en_US |
dc.identifier.other | 1453467784 | |
dc.identifier.startpage | 247 | en_US |
dc.identifier.uri | http://www.yasambilimleridergisi.com/makale/pdf/1453467784.pdf | |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12402/1569 | |
dc.identifier.volume | 6 | en_US |
dc.language.iso | tr | en_US |
dc.publisher | Batman Üniversitesi | en_US |
dc.relation.journal | Batman Üniversitesi Yaşam Bilimleri Dergisi | en_US |
dc.relation.publicationcategory | Makale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Yayını | en_US |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | en_US |
dc.subject | İntegraz | en_US |
dc.subject | Anti-HIV ilaç tasarımı | en_US |
dc.subject | Ligand yerleştirme | en_US |
dc.subject | Moleküler Dinamik Simülasyonu | en_US |
dc.subject | Integraze | en_US |
dc.subject | Anti-HIV drug design | en_US |
dc.subject | Docking | en_US |
dc.subject | Molecular Dynamics Simulation | en_US |
dc.title | Yeni tasarlanan ve daha önceden çalışılmış bazı anti-HIV integraz ligandlarının autodock vina ile HIV-1 integraz enzimi katalitik öz bölgesine yerleştirilmesi ve analizleri | en_US |
dc.type | Article | en_US |